PCR

Definisi :  Polymerase Chain Reaction adalah suatu teknik yang digunakan untuk membuat banyak salinan dari suatu segmen DNA, proses ini akan menghasilkan sejumlah besar salinan dari sampel awal yang kecil

Fungsi : membuat salinan DNA yang memungkinkan sejumlah kecil sekuens DNA disalin berkali-kali untuk diperbanyak sehingga dapat dianalisa atau dimodifikasi secara tertentu. Sebagai contoh dapat digunakan untuk :

  • menambahkan situs enzim restriksi
  • memutasikan (mengubah) basa tertentu pada DNA
  • mendeteksi keberadaan sekuens DNA tertentu dalam sampel

Prinsip Kerja

  • Meniru bagaimana DNA diperbanyak
  • Sampel untuk PCR bisa didapatkan dari darah, sputum, urine, ataupun cairan serebrospinal (CSF)
  • Pada prosesnya, PCR membutuhkan :
    • Taq Polymerase
    • DNA polymerase
    • Primer
    • DNA templat dan nukleotida (blok pembangun DNA)
    • Buffer

Langkah kerja PCR

Seluruh bahan digabung pada tube → ditambahkan kofaktor yang dibutuhkan enzim → melewati siklus pemanasan dan pendinginan → mendukung terjadinya replikasi → memungkinkan terjadinya amplifikasi DNA. Akan terjadi 3 proses :

  • Denaturation / denaturasi (96°C) = Pada proses denaturasi, panas mempengaruhi strand DNA akan terpisah menjadi DNA beruntai tunggal (single-stranded).
  • Annealing / penempelan (55-65°C) = Pada tahap penempelan ini, suhu annealing primer akan menempel dan berikatan pada daerah komplementer pada sekuen single-stranded DNA.
  • Extension / elongasi (72°C) = Pada suhu ini Taq polymerase melakukan pemanjangan membentuk strand DNA baru.

Selanjutnya, Hasil PCR akan divisualisasi menggunakan Gel Electrophoresis.

Dikutip dari :